Árni Hjartarson fæddist 14. júní 1949 á Hótel KEA á Akureyri og er alinn upp á Tjörn í Svarfaðardal. Þar er hann með lögheimili en á annað heimili í Reykjavík. Árni gekk í Húsabakkaskóla og Gagnfræðaskóla Dalvíkur, varð stúdent frá MA, eðlisfræðideild, 1969, lauk BS-prófi í jarðfræði frá HÍ 1973, MS-prófi í vatnajarðfræði frá HÍ 1994 og doktorsprófi frá Kaupmannahafnarháskóla 2004 í jarðlagafræði og jarðsögu.
Meira